Zapis parametrów .jar-a do tablicy

 Instances data = loadData("./src/data/"+args[0]);
        Remove remove = new Remove();
        int[] attributes = {0, 1}; //Lista numerow atrybutow do usuniecia (numeracja od 0)
        remove.setAttributeIndicesArray(attributes); //Ustawienie listy do usuniecia
        remove.setInputFormat(data);
        Instances newData = Filter.useFilter(data, remove);  // Zastosowanie filtra
        saveData(newData, "./src/data/"+args[1]); //Zapis tablicy po filtracji 

 int[] attributes = {0, 1};

package terminalowy;

import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileReader;
import java.io.IOException;
import weka.core.Instances;
import weka.core.converters.ArffLoader;
import weka.core.converters.ArffSaver;
import weka.filters.Filter;
import weka.filters.unsupervised.attribute.Remove;


public class Terminalowy {
    
    //Odczytanie tablicy danych z dysku w formacie ARFF
    public static Instances loadData(String fileName)
    throws IOException
    {
        ArffLoader loader = new ArffLoader(); //Utworzenie obiektu czytajacego dane z formatu ARFF
        loader.setFile(new File(fileName)); //Ustawienie pliku do odczytania
        return loader.getDataSet(); //Odczytanie danych z pliku
    }
    
    //Zapis zbioru danych do formatu ARFF
    public static void saveData(Instances data,String fileName)
    throws IOException
    {
        ArffSaver saver = new ArffSaver(); //Utworzenie obiektu zapisujacego dane
        saver.setFile(new File(fileName)); //Ustawienie nazwy pliku do zapisu
        saver.setInstances(data);        
        saver.writeBatch(); //Zapis do pliku
    }
 
    public static void main(String[] args) throws Exception
    {
      
        try
        {
            System.out.println("Liczba parametrow="+args.length);        
            System.out.print("Parametry:");
            for (int i=0;i<args.length; i++)
            {
                System.out.print(args[i]+" ");
            }
            System.out.println();

            if (args.length<1)
            {
                System.out.println("Program oczekuje dwóch parametrow!");
                System.exit(0);                    
            }
            
        Instances data = loadData("./src/data/"+args[0]);
        Remove remove = new Remove();
        int[] attributes = {0, 1}; //Lista numerow atrybutow do usuniecia (numeracja od 0)
        remove.setAttributeIndicesArray(attributes); //Ustawienie listy do usuniecia
        remove.setInputFormat(data);
        Instances newData = Filter.useFilter(data, remove);  // Zastosowanie filtra
        saveData(newData, "./src/data/"+args[1]); //Zapis tablicy po filtracji
  
        
        }
        catch (Exception e) 
        {
          System.out.println("Blad:");
          e.printStackTrace();
        }
        
        
                BufferedReader strumienWe = new BufferedReader(new FileReader( "./src/data/"+args[1]));
                String pole = new String();
                String wiersz = strumienWe.readLine();
                while (wiersz != null) {
                    pole = pole + wiersz + "\n"; //dodanie znaku konca wiersza: \n			    	
                    wiersz = strumienWe.readLine();
                    System.out.println(wiersz); 
        
    }
   System.out.println("===================================");
   System.out.println("WYKONANKO POPRAWNIE"); 
   System.out.println("ZAPISANO PLIK W: /src/data/"+args[1]); 
}
    
}

if (args.length<2) //tu miałeś złą nierówność
{
     System.out.println("Program oczekuje dwóch parametrow!");
     System.exit(0);                    
}
...
int[] attributes;
if(args.length == 2)
{
    attributes = new int[2];
    attributes[0] = 0;
    attributes[1] = 1;
}
else
{
    attributes = new int[args.length - 2];
    for(int i=2;i<args.length;i++)
    {
        attributes[i-2] = Integer.parseInt(args[i]);
    }
}