Po pierwsze chciałabym powitać wszystkich!
Właśnie rozpoczynam przygodę z językami programowania, których będę używać w świecie bioinformatyki (gentyka/analiza sekwencji itd.). Po poniższym pytaniu od razu poznacie, że jestem zielona Mrugnięcie
Potrzebuje skompresować / skompilować kilka plików w formacie fasta do jednego (finalnie również w tym samym formacie). Z tego co czytałam najlepiej wykonać to w Pythonie.
Znalazłam na forach bioinformatycznych wskazówki z treściami komend typu:
cat /your/path/to/folder/*.fasta > newname.fasta
https://www.researchgate.net/post/How_do_I_merge_several_multisequence-fasta_files_to_create_one_tree_for_subsequent_Unifrac_analysis
lub
cd d:\data
cat *.fasta.txt > d:\combined.fasta
https://www.biostars.org/p/127239/
Niestety po zastosowaniu, którejkolwiek z nich (być może popełniam jakiś totalnie szczeniacki błąd) otrzymuje informację zwrotną: "invalid syntax" - czyli jak zdążyłam się dowiedzieć - Python mnie nie rozumie Mrugnięcie
Co mogę zrobić, może znacie jakieś inne sposoby? Z góry dziękuję za wskazówki!
