Analiza sekwencji obrazów

Analiza sekwencji obrazów
MI
  • Rejestracja:prawie 11 lat
  • Ostatnio:prawie 11 lat
  • Postów:2
0

Witam,

Mam do zrobienia program, który będzie miał za zadanie automatyczną analizę sekwencji zdjęć. Dostałem folder z 2700 zdjęciami tętnicy, której średnica się zmienia i moim zadaniem jest stworzenie programu, który będzie w stanie mierzyć tę średnicę.

http://imageshack.com/a/img844/7196/fifc.jpg <-- Przykładowe zdjęcie. Reszta jest identyczna, jedynie średnica tętnicy ulega zmianie.

Po pierwsze muszę na zdjęciu jakoś wykryć sam element tętnicy, następnie jego krawędzie i zmierzyć odległość między górną i dolną krawędzią, ale nie wiem jak się za to zabrać.

Prosiłbym o podpowiedź z jakich bibliotek skorzystać. Chodzi po pierwsze o to jak przeprowadzić analizę sekwencji zdjęć, czy wczytać je do tablicy i po kolei analizować, czy jakoś inaczej oraz o sam pomiar średnicy.

edytowany 1x, ostatnio: Mixx
airborn
  • Rejestracja:ponad 15 lat
  • Ostatnio:prawie 7 lat
  • Postów:274
1
Mixx napisał(a):

Prosiłbym o podpowiedź z jakich bibliotek skorzystać.

OpenCV

Mixx napisał(a):

Chodzi po pierwsze o to jak przeprowadzić analizę sekwencji zdjęć, czy wczytać je do tablicy i po kolei analizować

Moim zdaniem lepiej wczytywać po zdjęciu, w sensie wczytanie zdjęcia, analiza, zapisanie wyniku i zapętlić.

Mixx napisał(a):

Po pierwsze muszę na zdjęciu jakoś wykryć sam element tętnicy, następnie jego krawędzie i zmierzyć odległość między górną i dolną krawędzią, ale nie wiem jak się za to zabrać.

Czy aparat był umocowany jakoś na stałe? Jeżeli nie, to będziesz miał problem z określeniem średnicy - będziesz znał rozmiar w pikselach ale dla każdego zdjęcia może on oznaczać inną średnicę wyrażoną w centymetrach. Jeżeli aparat był umocowany na stałe, to odchodzi Ci problem z przeliczeniem piksele -> mm. W takiej sytuacji mógłbyś również zawęzić obszar na którym może występować tętnica. Samą tentnicę powinieneś był odnależć nawet prostym filtrem do detekcji krawędzi (wg. tego nawet najprostszy operator Sobela powinien dać radę

edytowany 1x, ostatnio: airborn
MI
  • Rejestracja:prawie 11 lat
  • Ostatnio:prawie 11 lat
  • Postów:2
0

Wiem już jak wykonać filtrację krawędziową. Otrzymuję coś takiego:
http://imagizer.imageshack.us/a/img837/2451/ju98.jpg

Próbowałem wykryć tętnicę jako jeden blob przy użyciu biblioteki blobscanner, ale nie udaje się to bo wykrywa wiele różnych mniejszych elementów. Ma ktoś pomysł w jakiy sposób zmierzyć tę wysokość/średnicę tętnicy?

__krzysiek85
  • Rejestracja:ponad 18 lat
  • Ostatnio:około 9 lat
  • Postów:1019
0

Jeżeli wszystkie tętnice mają podobny kolor, to swoją analizę możesz oprzeć na wykrywaniu tego koloru oraz usuwania szumu (małych skupisk poszukiwanego koloru).
Kilka lat temu robiłem coś takiego w C za pomocą OpenCV, ale szczegółów nie pamiętam.
Widzę jednak, że teraz OpenCV ma już binding do Javy: http://opencv.org/opencv-java-api.html


Registered Linux user #456405 | SCJP 6 | SCWCD 5 | SCBCD 5
airborn
  • Rejestracja:ponad 15 lat
  • Ostatnio:prawie 7 lat
  • Postów:274
0

Moim zdaniem powinieneś popracować jeszcze nad wstępną filtracją, tak aby po detekcji krawędziowej odsiać większość tych szumów które teraz masz. Poeksperymentuj z jakimiś rozmyciami, dylacjami i erozjami zanim będziesz robić filtrację krawędziową.

__krzysiek85
  • Rejestracja:ponad 18 lat
  • Ostatnio:około 9 lat
  • Postów:1019
0

Moim zdaniem samo wykrywanie krawędzie nie sprawdzi się w tym przypadku, gdyż na zdjęciu są też inne obiekty, które nas nie interesują.
Oczywiście można spróbować połączyć obydwie techniki - wykrywanie określonego koloru oraz krawędzi (aby pomijać krawędzie obiektów o innych kolorach).


Registered Linux user #456405 | SCJP 6 | SCWCD 5 | SCBCD 5
Kliknij, aby dodać treść...

Pomoc 1.18.8

Typografia

Edytor obsługuje składnie Markdown, w której pojedynczy akcent *kursywa* oraz _kursywa_ to pochylenie. Z kolei podwójny akcent **pogrubienie** oraz __pogrubienie__ to pogrubienie. Dodanie znaczników ~~strike~~ to przekreślenie.

Możesz dodać formatowanie komendami , , oraz .

Ponieważ dekoracja podkreślenia jest przeznaczona na linki, markdown nie zawiera specjalnej składni dla podkreślenia. Dlatego by dodać podkreślenie, użyj <u>underline</u>.

Komendy formatujące reagują na skróty klawiszowe: Ctrl+B, Ctrl+I, Ctrl+U oraz Ctrl+S.

Linki

By dodać link w edytorze użyj komendy lub użyj składni [title](link). URL umieszczony w linku lub nawet URL umieszczony bezpośrednio w tekście będzie aktywny i klikalny.

Jeżeli chcesz, możesz samodzielnie dodać link: <a href="link">title</a>.

Wewnętrzne odnośniki

Możesz umieścić odnośnik do wewnętrznej podstrony, używając następującej składni: [[Delphi/Kompendium]] lub [[Delphi/Kompendium|kliknij, aby przejść do kompendium]]. Odnośniki mogą prowadzić do Forum 4programmers.net lub np. do Kompendium.

Wspomnienia użytkowników

By wspomnieć użytkownika forum, wpisz w formularzu znak @. Zobaczysz okienko samouzupełniające nazwy użytkowników. Samouzupełnienie dobierze odpowiedni format wspomnienia, zależnie od tego czy w nazwie użytkownika znajduje się spacja.

Znaczniki HTML

Dozwolone jest używanie niektórych znaczników HTML: <a>, <b>, <i>, <kbd>, <del>, <strong>, <dfn>, <pre>, <blockquote>, <hr/>, <sub>, <sup> oraz <img/>.

Skróty klawiszowe

Dodaj kombinację klawiszy komendą notacji klawiszy lub skrótem klawiszowym Alt+K.

Reprezentuj kombinacje klawiszowe używając taga <kbd>. Oddziel od siebie klawisze znakiem plus, np <kbd>Alt+Tab</kbd>.

Indeks górny oraz dolny

Przykład: wpisując H<sub>2</sub>O i m<sup>2</sup> otrzymasz: H2O i m2.

Składnia Tex

By precyzyjnie wyrazić działanie matematyczne, użyj składni Tex.

<tex>arcctg(x) = argtan(\frac{1}{x}) = arcsin(\frac{1}{\sqrt{1+x^2}})</tex>

Kod źródłowy

Krótkie fragmenty kodu

Wszelkie jednolinijkowe instrukcje języka programowania powinny być zawarte pomiędzy obróconymi apostrofami: `kod instrukcji` lub ``console.log(`string`);``.

Kod wielolinijkowy

Dodaj fragment kodu komendą . Fragmenty kodu zajmujące całą lub więcej linijek powinny być umieszczone w wielolinijkowym fragmencie kodu. Znaczniki ``` lub ~~~ umożliwiają kolorowanie różnych języków programowania. Możemy nadać nazwę języka programowania używając auto-uzupełnienia, kod został pokolorowany używając konkretnych ustawień kolorowania składni:

```javascript
document.write('Hello World');
```

Możesz zaznaczyć również już wklejony kod w edytorze, i użyć komendy  by zamienić go w kod. Użyj kombinacji Ctrl+`, by dodać fragment kodu bez oznaczników języka.

Tabelki

Dodaj przykładową tabelkę używając komendy . Przykładowa tabelka składa się z dwóch kolumn, nagłówka i jednego wiersza.

Wygeneruj tabelkę na podstawie szablonu. Oddziel komórki separatorem ; lub |, a następnie zaznacz szablonu.

nazwisko;dziedzina;odkrycie
Pitagoras;mathematics;Pythagorean Theorem
Albert Einstein;physics;General Relativity
Marie Curie, Pierre Curie;chemistry;Radium, Polonium

Użyj komendy by zamienić zaznaczony szablon na tabelkę Markdown.

Lista uporządkowana i nieuporządkowana

Możliwe jest tworzenie listy numerowanych oraz wypunktowanych. Wystarczy, że pierwszym znakiem linii będzie * lub - dla listy nieuporządkowanej oraz 1. dla listy uporządkowanej.

Użyj komendy by dodać listę uporządkowaną.

1. Lista numerowana
2. Lista numerowana

Użyj komendy by dodać listę nieuporządkowaną.

* Lista wypunktowana
* Lista wypunktowana
** Lista wypunktowana (drugi poziom)

Składnia Markdown

Edytor obsługuje składnię Markdown, która składa się ze znaków specjalnych. Dostępne komendy, jak formatowanie , dodanie tabelki lub fragmentu kodu są w pewnym sensie świadome otaczającej jej składni, i postarają się unikać uszkodzenia jej.

Dla przykładu, używając tylko dostępnych komend, nie możemy dodać formatowania pogrubienia do kodu wielolinijkowego, albo dodać listy do tabelki - mogłoby to doprowadzić do uszkodzenia składni.

W pewnych odosobnionych przypadkach brak nowej linii przed elementami markdown również mógłby uszkodzić składnie, dlatego edytor dodaje brakujące nowe linie. Dla przykładu, dodanie formatowania pochylenia zaraz po tabelce, mogłoby zostać błędne zinterpretowane, więc edytor doda oddzielającą nową linię pomiędzy tabelką, a pochyleniem.

Skróty klawiszowe

Skróty formatujące, kiedy w edytorze znajduje się pojedynczy kursor, wstawiają sformatowany tekst przykładowy. Jeśli w edytorze znajduje się zaznaczenie (słowo, linijka, paragraf), wtedy zaznaczenie zostaje sformatowane.

  • Ctrl+B - dodaj pogrubienie lub pogrub zaznaczenie
  • Ctrl+I - dodaj pochylenie lub pochyl zaznaczenie
  • Ctrl+U - dodaj podkreślenie lub podkreśl zaznaczenie
  • Ctrl+S - dodaj przekreślenie lub przekreśl zaznaczenie

Notacja Klawiszy

  • Alt+K - dodaj notację klawiszy

Fragment kodu bez oznacznika

  • Alt+C - dodaj pusty fragment kodu

Skróty operujące na kodzie i linijkach:

  • Alt+L - zaznaczenie całej linii
  • Alt+, Alt+ - przeniesienie linijki w której znajduje się kursor w górę/dół.
  • Tab/⌘+] - dodaj wcięcie (wcięcie w prawo)
  • Shit+Tab/⌘+[ - usunięcie wcięcia (wycięcie w lewo)

Dodawanie postów:

  • Ctrl+Enter - dodaj post
  • ⌘+Enter - dodaj post (MacOS)